Para alterar os nomes dos arquivos utilizando um arquivo .bat, você pode seguir os seguintes passos:
Para o seu caso específico, você pode criar um arquivo .bat com os comandos de renomeação para remover a parte "mdl" do nome dos arquivos. Por exemplo:
ren .mdl.gz .gz
Isso irá renomear todos os arquivos com a extensão .mdl.gz para apenas .gz.
Espero que esta resposta seja útil para você!